Hvert år afholdes årsmøde, hvor alle medlemmer har både tale- og stemmeret. På årsmødet vælger medlemmerne en hovedbestyrelse. Hovedbestyrelsen nedsætter 10 storkredsbestyrelser og udpeger 10 storkredsformænd, som indgår i Hovedbestyrelsen. Hovedbestyrelsen ledes af den politiske leder, som vælges på årsmødet.
Moderaternes hovedbestyrelse består af den politiske leder, 10 medlemmer, som er valgt på årsmødet, 1 repræsentant for folketingsgruppen, 1 repræsentant for Foreningen af 8. januar, 2 repræsentanter for Unge Moderater, 1 repræsentant for indvalgte i kommunalbestyrelser, 1 repræsentant for indvalgte i regionsråd, 1 repræsentant for indvalgte i Europa-Parlamentet, 1 landskasserer samt kredsformanden for hver af de ti storkredse.
Hovedbestyrelsen har ansvaret for ledelsen af Moderaterne. Læs om Hovedbestyrelsens virke og se medlemmerne på denne side.
Der er 10 storkredse i Moderaterne, der har ansvar for at organisere Moderaterne lokalt.
